Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Grin2cQ01098 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms