Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms