Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoa1Q00623 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms