Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms