Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ElocP83940 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ElocP83940 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ElocP83940 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ElocP83940 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ElocP83940 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ElocP83940 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ElocP83940 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ElocP83940 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ElocP83940 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ElocP83940 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ElocP83940 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ElocP83940 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ElocP83940 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms