Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SeboxP70368 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms