Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54lP70270 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54lP70270 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54lP70270 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54lP70270 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad54lP70270 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms