Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SbdsP70122 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms