Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms