Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms