Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn18P56857 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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