Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms