Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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CartptP56388 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CartptP56388 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CartptP56388 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CartptP56388 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CartptP56388 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CartptP56388 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms