Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms