Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CcnfP51944 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CcnfP51944 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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CcnfP51944 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms