Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cox8bP48772 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms