Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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