Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms