Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VhlP40338 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VhlP40338 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VhlP40338 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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VhlP40338 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VhlP40338 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VhlP40338 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms