Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdh15P33146 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms