Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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