Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tacr1P30548 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tacr1P30548 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms