Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms