Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HexaP29416 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HexaP29416 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HexaP29416 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HexaP29416 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms