Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RxrgP28705 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrgP28705 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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