Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Hoxd10P28359 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd10P28359 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd10P28359 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd10P28359 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Hoxd10P28359 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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