Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa2P28309 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms