Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6bP23440 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde6bP23440 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde6bP23440 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6bP23440 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde6bP23440 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde6bP23440 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6bP23440 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6bP23440 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde6bP23440 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pde6bP23440 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pde6bP23440 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde6bP23440 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pde6bP23440 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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