Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NelfeP19426 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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