Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PcnaP17918 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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