Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spi1P17433 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms