Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P10404 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P10404 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P10404 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms