Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Myod1P10085 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Myod1P10085 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms