Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxa5P09021 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms