Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P06330 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P06330 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P06330 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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