Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P06323 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P06323 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P06323 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P06323 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P06323 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P06323 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P06323 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P06323 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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