Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfrbP05622 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms