Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ChkaO54804 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ChkaO54804 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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