Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Psmb10O35955 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Psmb10O35955 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Psmb10O35955 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Psmb10O35955 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Psmb10O35955 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Psmb10O35955 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Psmb10O35955 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Psmb10O35955 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Psmb10O35955 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Psmb10O35955 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Psmb10O35955 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb10O35955 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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