Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Opn1mwO35599 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms