Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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