Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casq1O09165 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casq1O09165 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casq1O09165 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casq1O09165 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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