Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EllO08856 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EllO08856 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EllO08856 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EllO08856 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EllO08856 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EllO08856 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EllO08856 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EllO08856 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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EllO08856 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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EllO08856 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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EllO08856 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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EllO08856 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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EllO08856 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EllO08856 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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EllO08856 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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EllO08856 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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EllO08856 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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EllO08856 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
EllO08856 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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