Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sema3aO08665 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms