Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec22bO08547 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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