Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm6871L7N248 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm6871L7N248 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6871L7N248 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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