Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm379J3QQ19 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm379J3QQ19 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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