Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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BC024978J3QPC3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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BC024978J3QPC3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BC024978J3QPC3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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BC024978J3QPC3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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BC024978J3QPC3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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BC024978J3QPC3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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BC024978J3QPC3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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BC024978J3QPC3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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BC024978J3QPC3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BC024978J3QPC3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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BC024978J3QPC3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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