Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim18J3QNP2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms