Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn20G5E8X0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn20G5E8X0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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